Несмотря на недовольство Маккея, доктор Джексон прибывает в Атлантис, чтобы изучать труды Януса - Древнего, который изобрел машину времени. Изыскания приводят его к первому контакту с новой расой галактики Пегас, и эта раса настроена вовсе не дружелюбно по отношению к атлантийцам.