Sydney en Anna leren de binaire code van Milo Rambaldi uit hun hoofd. Sydney en Dixon krijgen als missie een complot te onderzoeken van terrorristen om de United Commerce Organization uit de weg te ruimen. Francie vermoedt dat haar vriend vreemdgaat, terwijl Will verdergaat met het ontrafelen van het mysterie rond de moord op de verloofde van Sydney.