Nadat een orkaan Tokio heeft getroffen, spoelt er een gigantisch ei aan. Het is een ei van het monster Mothra. Mothra stuurt zijn vrouwelijke dienaars naar Tokio om te vragen of ze het ei terug mogen nemen naar zijn oorspronkelijke plaats. Maar de op geld beluste investeerders weigeren. Wanneer wat later Godzilla ontwaakt en blijkt dat enkel Mothra weerstand kan bieden, weigert het monster als weerwraak. Ondertussen vernietigt Godzilla Tokio...