La serie si presenta come un seguito diretto di Transformers: Prime, ambientato alcuni anni dopo il lungometraggio Transformers: Predacons Rising: la guerra tra gli Autobot e i Decepticon, che aveva visto anche la Terra come suo teatro, sembra finita e il potente Bumblebee e gli altri Autobot hanno fatto ritorno sul pianeta Cybertron. Durante una pattuglia però Bumblebee riceve un messaggio da Optimus Prime: la Terra è di nuovo in pericolo e deve farvi ritorno. Una navicella dei Decepticon si è infatti schiantata sul pianeta ed i detenuti sono liberi, ma Optimus lo informa che anche un male maggiore sta per arrivare. Bumblebee fa quindi ritorno sulla Terra, al comando di una nuova squadra ritrovandosi quindi nei panni del comandante, con l'obiettivo di ricatturare tutti i Decepticon scappati e aspettando il ritorno di Optimus Prime.