Suite à la destruction du virus dans la Chambre Noire en 2015, Cole est renvoyé vers un 2043 alternatif, où le complexe est contrôlé par les West Seven, dirigés par Ramse. Dans cette réalité, Cole est mort et la machine à voyager dans le temps n'est plus utilisée. Cole retrouve Jones, qui ne le reconnaît pas et n'a jamais entendu parler de Cassandra. En revanche, elle lui apprend que dans sa réalité, le fléau a été déclenché en 2016 en Tchétchénie, par une agence gouvernementale américaine au cours d'une opération appelée «Opération Troy». Cole découvre que Cassie a été tuée à la sortie de la Chambre Noire en 2015...