Након година заклона од људског света, браћа корњачe су кренули да освоје срца Њујорчана и да буду прихваћени као нормални тинејџери кроз херојске поступке. Њихова нова пријатељица Ејприл О'Нил помаже им да се суоче са мистериозним злочиначким синдикатом, али убрзо им се провали кроз главу када је војска мутаната пуштена на њих.