Píše sa rok 2077. Ubehlo 10 let od doby, keď se Japonsko rozhodlo opustiť rady OSN. Celý ostrov je teraz obklopený ultramagnetickým poľom, ktoré bráni vstupu do krajiny. Špionážna služba USA získava znepokojivú informáciu, že Japonsko pracuje na ultimátnej zbrani, ktorá môže predstavovať smrteľnú hrozbu pro celý svat. Je vyslaná vojenská jednotka SWORD, ktorej velí VEXILLE a její milenec LEON. Členovia SWORDu se vydávajú na nebezpečnú misiu do neznáma..