Durante a Guerra de Um Ano da U.C. 0079, a Federação da Terra e o Principado de Zeon se envolvem em uma feroz batalha no "Setor Thunderbolt", uma zona de cardumes no antigo Colony Side 4 "Moore". Depois de se infiltrar com sucesso no campo de atiradores de elite de Zeon, o piloto da Federação e entusiasta do jazz Io Fleming recebe o controle do mais recente protótipo Gundam.