Wanneer Naruto, Shikamaru, en Sakura midden in een missie zitten om een huisdier in een bepaald dorp af te leveren worden zij onverwachts aangevallen door de mysterieuze en gevaarlijke samoerai Temujin. Het zware gevecht heeft als resultaat dat de drie vrienden van elkaar verwijderd worden en oog in oog komen te staan met een haast nog groter gevaar dan Temujin ...