All'inizio dell'era Meiji, il vagabondo Kenshin Himura giunge a Tokyo custodendo un oscuro passato. Un tempo spietato assassino conosciuto come Battosai, l'uomo vaga ora per il paese con una spada a lama invertita, determinato a proteggere i deboli senza più uccidere. L'incontro con Kaoru Kamiya, giovane maestra del dojo di famiglia, spingerà Kenshin a fermarsi e affrontare i fantasmi del suo passato.