Sydney va in Cecenia per liberare la sorella, che è detenuta in un campo di prigionia. Vaughn viene rapito e torturato da Lauren e Sark che vogliono sapere dov'è il Passeggero. Sloane informa Sark ed approfitta di una irruzione per scomparire con la figlia Nadia. Vaughn implora Sydney di non cercare la sorellastra.