Ichika Orimura se voit intégrer la prestigieuse école IS après qu'il a réveillé une armure par accident. Il devient ainsi le premier homme sur Terre à maîtriser un IS, ce qui fait de lui la nouvelle coqueluche de toutes les lycéennes. Le jeune homme est quelque peu déstabilisé par cet entourage uniquement féminin : sa sœur, ancienne championne du monde, comme professeur principal, son amie d'enfance, Hôki Shinonono, et leurs retouvailles difficiles, et un défi, dès le premier jour, imposé par la très talentueuse et très noble Cécilia Alcott, qui souhaite devenir déléguée de classe.