Cobra Commander sabote la première expérience du Dr. Mindbender, et il s’élève comme un monstre hideux. Le sergent Slaughter s’échappe brièvement, puis est repris mais parvient à détruire son échantillon d’ADN. La deuxième tentative est réussie, et Serpentor est créé. Pendant ce temps, une équipe de recherche de Joe est envoyée sur l’île Cobra pour sauver Slaughter et en apprendre plus sur les plans de Cobra.