Reese et Finch se retrouvent piégés dans un hôpital qui devient le point de départ d'une épidémie virale mortelle. De leurs côtés, la nouvelle recrue de Samaritain a des doutes et Shaw continue à lutter avec la réalité. Shaw s'évade de la prison où la tient Samaritain. Reese suit quant à lui monsieur Ko, un homme d'affaires international, tombé malade. Infecté par un virus mystérieux, Ko meurt aux urgences d'un hôpital. Reese et Harold se retrouvent par conséquent piégés dans cet hôpital, où ils tentent à la fois de trouver le véritable responsable de la mort de Ko et de juguler l'épidémie...