Nach 15 Tage langen heftigen Kämpfen gelingt es der Umibozu, Sektion 9 aufzulösen, indem sie Kusanagi ermorden und Batou festnehmen. Die Auflösung von Sektion 9, die von den Medien als Präventivschlag des Verteidigungsministeriums gegen eine radikale Sicherheitstruppe dargestellt wird, verleiht dem Premierminister die nötige öffentliche Unterstützung, die seine Partei braucht, um die Unterhauswahlen zu gewinnen. Drei Monate vergehen, in denen Togusa versucht, das Schicksal von Sektion 9 in Erfahrung zu bringen.