Nadat hij om zeer persoonlijke redenen de chirurgische praktijk de rug heeft toegekeerd, wijdt de geniale forensisch patholoog en voormalig neurochirurg Haruto Hatsushima zich aan het ontcijferen van de stille kreten van de doden; hij is hiervoor werkzaam bij het Nationaal Centrum voor Forensische Autopsie. Dagelijks ontvangt het centrum lichamen van mensen die op mysterieuze wijze zijn overleden. Achter deze sterfgevallen schuilt een zeldzame ziekte die met conventionele methoden niet op te sporen is – een raadsel dat in de dood zelf besloten ligt, een 'raadsel van God' dat Haruto vastbesloten is op te lossen.